简 历
牛国清 博士，研究员，博士生导师
西南大学生物技术中心
男，汉族，1976年7月生，山西省长治市人
电子邮箱：niu062376@swu.edu.cn
2006年于中国科学院研究生院获得博士学位，2006-2010年在美国俄克拉荷马大学健康科学中心做博士后研究工作，2010-2017年在中国科学院微生物研究所历任副研究员、项目研究员，2017年通过西南大学"聚贤工程"人才引进计划，受聘为生物技术中心研究员，同年遴选为“首批引进人才聘任高校巴渝学者特聘教授”，2018年入选重庆市“科技创新领军人才支持计划”。
一、教育经历
2006年 中国科学院微生物研究所，遗传学，博士；
2002年 西南大学，生化与分子生物，硕士；
1998年 西南大学，农学，学士。
二、工作经历
2017年-现在 研究员 西南大学生物技术中心，研究方向为微生物天然产物生物合成与合成生物学；
2016年-2017年 项目研究员 中国科学院微生物研究所，微生物资源前期开发国家重点实验室，研究方向为微生物次级代谢产物的生物合成与调控；
2010年-2016年 副研究员 中国科学院微生物研究所，微生物资源前期开发国家重点实验室，研究方向为微生物次级代谢产物的生物合成与调控；
2006年-2010年 博士后 美国俄克拉荷马大学健康科学中心，微生物学与免疫学系，研究方向为生物膜中变形链球菌的遗传与生化研究。
三、科研业绩
长期致力于微生物次级代谢产物生物合成与合成生物学方面的研究，近年来已在Trends in Biochemical Sciences、Trends in Biotechnology、FEMS Microbiology Reviews、Trends in Microbiology、Molecular Cell、Metabolic Engineering、Cell Chemical Biology、Journal of Biological Chemistry、ACS Synthetic Biology、Molecular Microbiology、Applied and Environmental Microbiology等SCI收录刊物发表论文30余篇。相关成果受到Faculty of 1000评述和推荐，以及Molecular Microbiology、Current Opinion in Chemical Biology和Annual Review of Microbiology等杂志的引用和评述。
主持国家自然科学基金面上项目、国家重点研发计划“合成生物学”重点专项子课题、重庆市“科技创新领军人才支持计划”项目、西南大学“聚贤工程”启动项目、重庆市自然科学基金、重庆市基础科学与前沿技术研究一般项目和中央高校基本业务费专项。
四、发表论文
1. Li Z, He L, Wang X, Huo Q, Zheng G, Kong D, Lu Y, Xia H, Niu G*. (2023) Elucidation of the ferrichrome siderophore biosynthetic pathway in albomycin-producing Streptomyces sp. ATCC 700974. Journal of Biological Chemistry (In press) doi: 10.1016/j.jbc.2023.104573.
2. Liu M, Wang K, Wei J, Liu N, Niu G, Tan H, Huang Y*. (2023) Comparative and functional analyses reveal conserved and variable regulatory systems that control lasalocid biosynthesis in different Streptomyces species. Microbiology Spectrum (In press) doi: 10.1128/spectrum.03852-22.
3. Wang M, Zhang Y, Lv L, Kong D, Niu G*. (2022) Biosynthesis and chemical synthesis of albomycin nucleoside antibiotics. Antibiotics 11: 438.
4. 邹莹，吴嘉炳，张雨欣，李殿怡，牛国清*，司军*。（2022）茎瘤芥根际一株产紫色杆菌素杜擀氏菌的分离鉴定及其基因组分析。微生物学报。62: 4122–4140.
5. Li Z, Huang P, Wang M, Wang X, Wang L, Kong D, Niu G*. (2021) Stepwise increase of thaxtomins production in Streptomyces albidoflavus J1074 through combinatorial metabolic engineering. Metabolic Engineering 68:187-198
6. Wang X, Fu Y, Wang M, Niu G*. (2021) Synthetic cellobiose-inducible regulatory systems allow tight and dynamic controls of gene expression in Streptomyces. ACS Synthetic Biology 10(8):1956-1965.
7. Liu N, Guan H, Niu G, Jiang L, Li Y, Zhang J, Li J, Tan H*.(2021) Molecular mechanism of mureidomycin biosynthesis activated by introduction of an exogenous regulatory gene ssaA into Streptomyces roseosporus. Science China Life Sciences doi: 10.1007/s11427-020-1892-3.
8. Wang L, Wang M, Fu Y, Huang P, Kong D, Niu G*. (2020) Engineered biosynthesis of thaxtomin phytotoxins. Critical Reviews in Biotechnology 40(8):1163-1171.
9. Niu G*, Li W*. (2019) Next-generation drug discovery to combat antimicrobial resistance. Trends in Biochemical Sciences 44(11):961-972.
10. Kong D, Wang X, Nie J, Niu G*.(2019) Regulation of antibiotic production by signaling molecules in Streptomyces. Frontiers in Microbiology 10:2927.
11. Niu G, Li Z, Huang P, Tan H*. (2019) Engineering nucleoside antibiotics toward the development of novel antimicrobial agents. Journal of Antibiotics 72(12):906-912.
12. Niu G*. (2018) Genomics-driven natural product discovery in actinomycetes. Trends in Biotechnology 36(3):238-241.
13. Li J, Li Y, Niu G, Guo H, Qiu Y, Lin Z, Liu W* and Tan H*. (2018) NosP-regulated nosiheptide production responds to both peptidyl and small-molecule ligands derived from the precursor peptide. Cell Chemical Biology 25(2):143-153.
14. Wei J, He L, Niu G*. (2018) Regulation of antibiotic biosynthesis in actinomycetes: Perspectives and challenges. Synthetic and Systems Biotechnology 3(4):229-235.
15. Niu G, Zheng J, Tan H*. (2017) Biosynthesis and combinatorial biosynthesis of antifungal nucleoside antibiotics. Science China Life Sciences 60(9):939-947.
16. Niu G, Chater KF, Tian Y, Zhang J and Tan H*. (2016) Specialised metabolites regulating antibiotic biosynthesis in Streptomyces spp. FEMS Microbiology Reviews 40(4):554-573.
17. 韦俊宏，张集慧，江玲娟，谭华荣，牛国清*。（2016）谷氏菌素生物合成基因gouC和gouD的功能研究。微生物学报。56: 406-417.
18. Niu G, Tan H*. (2015) Nucleoside antibiotics: biosynthesis, regulation and biotechnology. Trends in Microbiology 23(2): 110-119.
19. Liu N, Niu G, Xie Z, Chen Z, Itzek A, Kreth J, Gillaspy A, Zeng L, Burne R, Qi F, Merritt J*. (2015) The Streptococcus mutans irvA gene encodes a trans-acting riboregulatory mRNA. Molecular Cell 57(1):179-190.
20. Jiang L#, Wang L#, Zhang J, Liu H, Hong B, Tan H*, Niu G*. (2015) Identification of novel mureidomycin analogues via rational activation of a cryptic gene cluster in Streptomyces roseosporus NRRL 15998. Scientific Reports 5:14111.
21. Du D#, Wang L#, Tian Y, Liu H, Tan H*, Niu G*. (2015) Genome engineering and direct cloning of antibiotic gene clusters via phage fBT1 integrase-mediated site-specific recombination in Streptomyces. Scientific Reports 5:8740.
22. 王璐，杜德尧，李金娥，田宇清，刘浩* ，牛国清* ，谭华荣。（2015）尼可霉素生物合成基因簇的改造及其异源表达。微生物学报。55 :707-718.
23. Zou Z, Du D, Zhang Y, Zhang J, Niu G*, Tan H*. (2014) A γ-butyrolactone-sensing activator/repressor, JadR3, controls a regulatory mini-network for jadomycin biosynthesis. Molecular Microbiology 94(3):490-505.
24. Wei J, Tian Y, Niu G*, and Tan H*. (2014) GouR, a TetR-family transcriptional regulator, coordinates the biosynthesis and export of gougerotin in Streptomyces graminearus. Applied and Environmental Microbiology 80(2): 714-722.
25. Feng C, Ling H, Du D, Zhang J, Niu G*, Tan H*. (2014) Novel nikkomycin analogues generated by mutasynthesis in Streptomyces ansochromogenes. Microbial Cell Factories 13(1): 59.
26. Niu G#, Li L#, Wei J, Tan H*. (2013) Cloning, heterologous expression, and characterization of the gene cluster required for gougerotin biosynthesis. Cell Chemical Biology 20(1): 34-44.
27. Liu G, Chater KF, Chandra G, Niu G, Tan H*. (2013) Molecular regulation of antibiotic biosynthesis in Streptomyces. Microbiology and Molecular Biology Reviews 77(1): 112-143.
28. Du D, Zhu Y, Wei J, Tian Y, Niu G*, Tan H*. (2013) Improvement of gougerotin and nikkomycin production by engineering their biosynthetic gene clusters. Applied Microbiology and Biotechnology 97(14): 6383-6396.
29. Jiang L, Wei J, Li L, Niu G*, Tan H*. (2013) Combined gene cluster engineering and precursor feeding to improve gougerotin production in Streptomyces graminearus. Applied Microbiology and Biotechnology 97(24): 10469–10477.
30. Niu G, Tan H*. (2013) Biosynthesis and regulation of secondary metabolites in microorganisms. Science China Life Sciences 56(7): 581-583.
五、承担项目
1. 国家自然科学基金面上项目“核苷肽类抗生素阿波霉素的生物合成研究”，2019年-2022年，主持；
2. 国家重点研发计划“合成生物学”重点专项 “高值化合物生物合成体系的智能组装及高效运行”，2020年-2025年，子课题主持；
3. 国家自然科学基金面上项目“核苷肽类抗生素缩合机制的研究”，2015年-2018年，主持；
4. 国家自然科学基金面上项目“谷氏菌素生物合成重要调控基因－gouR作用的分子机制”，2012年-2015年，主持；
5. 重庆市“科技创新领军人才支持计划”项目，2019年-2021年，主持；
6. 西南大学“聚贤工程”启动项目，2017年-2022年，主持；
7. 重庆市基础科学与前沿技术研究一般项目，2018年-2020年，主持；
8. 重庆市自然科学基金，2019年-2021年，主持;
9. 中央高校基本业务费专项资金，2018-2019年，主持。